Los investigadores del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva, en Leipzig, Alemania, ha completado la secuencia del genoma de un Denisovan, un representante de un grupo asiático de los seres humanos extintos relacionados con los Neandertales. El genoma que fue liberado inmediatamente a la comunidad científica fue publicado en la revista Nature.

En el año 2010 los colegas habían presentado una versión preliminar del genoma de un pequeño fragmento de hueso de un dedo humano descubierto en la Cueva Denisova en el sur de Siberia. Las secuencias de ADN demostraron que este individuo venía de un grupo hasta ahora desconocido de los seres humanos extintos que se han conocido como Denisovans. Junto con su grupo hermano de los Neandertales, los Denisovans son los más cercanos parientes extintos de los seres humanos que viven actualmente.

El equipo de Leipzig ha desarrollado nuevas técnicas sensibles que les ha permitido obtener la secuencia completa del genoma Denisovan usando ADN extraído de menos de 10 miligramos del hueso del dedo con una muy alta resolución.

Este nivel de resolución es suficiente para establecer la relación de los Denisovan, los neandertales y los humanos de hoy en día. La versión actual del genoma completo permite incluso encontrar las pequeñas diferencias entre las copias de los genes que este individuo heredadó de su madre y su padre para ser distinguidos.

El 8 de febrero el grupo de Leipzig dispuso que la secuencia completa del genoma Denisovan estaría disponible para la comunidad científica a través de Internet.

El genoma representa el primero de alta cobertura de la secuencia completa del genoma de un grupo humano arcaico, todo un salto en el estudio de las formas extintas de los seres humanos. Es esperable que los biólogos sean capaces de utilizar este genoma para descubrir los cambios genéticos que son importantes para el desarrollo de la cultura humana moderna y la tecnología, y permitió a los humanos modernos salir de África y distribuirse alrededor del mundo hace unos 100.000 años.

El genoma también se espera que revelan nuevos aspectos de la historia de la Denisovans y los neandertales.

El hueso del dedo fue descubierto por los profesores Anatoly Derevianko y Michail Shunkov de la Academia Rusa de Ciencias en el año 2008, durante sus excavaciones en la Cueva Denisova, un sitio arqueológico único que contiene capas culturales que indican que la ocupación humana en el lugar comenzó hace 280.000 años atrás. El hueso del dedo fue encontrada en una capa que se ha fechado entre 50.000 y 30.000 años atrás.

Además, un molar fue descubierto en la misma cueva también y dio ADN mitocondrial que se asemeja al del hueso del dedo. El molar presenta características morfológicas claramente diferentes a las de los neandertales y los humanos modernos, lo que confirma que pertenece a una especie con una historia evolutiva distinta.

Referencia

Reich D, Green RE, Kircher M, Krause J, Patterson N, Durand EY, Viola B, Briggs AW, Stenzel U, Johnson PL, Maricic T, Good JM, Marques-Bonet T, Alkan C, Fu Q, Mallick S, Li H, Meyer M, Eichler EE, Stoneking M, Richards M, Talamo S, Shunkov MV, Derevianko AP, Hublin JJ, Kelso J, Slatkin M, Paabo S: Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia. Nature 2010,  doi:10.1038/nature08976.

Una minúscula cantidad de alcohol más que duplica la vida útil de un diminuto gusano llamado Caenorhabditis elegans. Eso encontraron científicos de UCLA que utilizan el nemátodo como modelo en estudios de envejecimiento. El hallazgo, publicado en la revista PLoS ONE es realmente sorprendente y difícil de explicar.

En los seres humanos, el consumo de alcohol es generalmente dañino. Igualmente es conocido que si los gusanos se le dan concentraciones mucho más altas de etanol, resulta en efectos neurológicos y la muerte

Los gusanos, que crecen a partir de un huevo a un estado adulto en tan sólo unos días, se encuentran en todo el mundo en el suelo, donde se alimentan de las bacterias. Los gusanos viven normalmente unos 15 días y pueden sobrevivir sin nada que comer más o menos 10 a 12 días. En este hallazgo una pequeña cantidad de etanol pueden sobrevivir los gusanos 20 a 40 días, es decir, más del doble de su vida normal.

¿Por qué el etanol puede tener tal efecto sobre la longevidad?

Realmente no sabemos todas las respuestas. Lo que sabemos que si aumentamos la concentración de etanol, no viven más tiempo. Sin embargo este nivel extremadamente bajo es lo más beneficioso para ellos. Los científicos encontraron que cuando se elevó el nivel de etanol en un factor de 80, no aumentó la esperanza de vida de los gusanos.

La investigación no responde a la pregunta de si pequeñas cantidades de etanol pueden ser útiles para la salud humana. Es decir, si este mecanismo tiene algo en común con las conocidas conclusiones de que el consumo moderado de alcohol en los seres humanos pueden tener un beneficio para la salud cardiovascular.

Aproximadamente la mitad de los genes de los gusanos tienen su contraparte humana, por lo que si los investigadores pueden identificar un gen que alarga la vida del gusano, que puede tener implicaciones para el envejecimiento humano.

Estos hallazgos podría ayudar a los investigadores para determinar cómo la fisiología humana se ve alterado para inducir efectos beneficiosos cardioprotectores u otros en respuesta al bajo consumo de alcohol.

Referencia

Paola V. Castro, Shilpi Khare, Brian D. Young, Steven G. Clarke. Caenorhabditis elegans Battling Starvation Stress: Low Levels of Ethanol Prolong Lifespan in L1 Larvae. PLoS ONE, 2012; 7 (1): e29984 DOI:10.1371/journal.pone.0029984

Una nueva investigación publicado en la revista FASEB Journal sugiere que la medición de la relación de las enzimas DYS14 y GAPDH en el plasma materno es un indicador eficaz para la detección precoz del sexo del feto en el primer trimestre.

El nuevo estudio de investigación describe los resultados que podrían conducir a una prueba no invasiva que permitiría a las mujeres embarazadas saber el sexo de sus bebé ya en el primer trimestre. Específicamente, los investigadores de Corea del Sur descubrieron que diferentes proporciones de dos enzimas (DYS14/GAPDH), que se puede extraer de la sangre de una madre embarazada, indica si el bebé será un niño o una niña.

En general, la determinación precoz del sexo del feto ha sido realizado por procedimientos invasivos como la biopsia de vellosidades coriónicas o la amniocentesis. Sin embargo, estos procedimientos invasivos aún tienen un riesgo de un 1 a un 2% de aborto involuntario y no se puede realizar hasta las 11 semanas de gestación.

Por otra parte, determinar de manera fiable del sexo del feto mediante ecografía no se puede realizar en el primer trimestre, debido a que el desarrollo de los genitales externos no está completa. Por lo tanto, esto puede reducir la necesidad de procedimientos invasivos en el caso de mujeres embarazadas con riesgo de anomalías ligadas al cromosoma X y aclarar las lecturas concluyentes por ultrasonido.

Para hacer este descubrimiento, los científicos recolectaron plasma materno a partir de 203 mujeres durante el primer trimestre del embarazo. La presencia de ADN fetal circulante fue confirmado por una reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa específica para medir la metilación de la cadena de U-PDE9A. La reacción en tiempo real se utilizó para cuantificar simultáneamente las cantidades de DYS14 y GAPDH en el plasma materno. Los resultados fueron confirmados por el fenotipo al nacer.

Aunque resta más trabajo por hacer antes de que una prueba esté masivamente disponible, este trabajo demuestra que es posible predecir el sexo de un feto tan pronto como las primeras semanas después de la concepción. En la actualidad, los padres se le dan a veces la información errónea sobre el sexo de su hijo por nacer, esta prueba debe ser útil en la resolución de las incertidumbres de las observaciones que ofrece la ecografía actual.

Referencia

Ji Hyae Lim, So Yeon Park, Shin Young Kim, Do Jin Kim, Ji Eun Choi, Min Hyoung Kim, Jun Seek Choi, Moon Young Kim, Jae Hyug Yang, and Hyun Mee Ryu. Effective detection of fetal sex using circulating fetal DNA in first-trimester maternal plasma. FASEB J. January 2012 26:250 doi:10.1096/fj.11-191429

Investigadores estadounidenses podrían revolucionar la forma en que son tratadas las víctimas de quemaduras. El invento, que parece y actúa más como un aerógrafo que como un arma de fuego, utiliza las propias células madre del paciente (tomadas de la piel sana), las combina en una solución para cargar el arma, y ​​luego las rocía sobre la superficie quemada. En el pequeño número de pacientes que han sido tratados, los resultados han sido poco menos que milagrosos: la piel que normalmente podría tomar semanas o meses para sanar rejuvenece en un día. Y a simple vista, las señales de las quemaduras son apenas visibles.

El cuerpo humano tiene la capacidad de curar una gran variedad de sus órganos y tejidos después de los daños causados ​​por los procesos de una enfermedad a largo plazo o por una lesión aguda. En la cirugía, se ha puesto énfasis en la sustitución de los tejidos enfermos por materiales sintéticos, o en cuidados intensivos en tecnología extracorpórea de órganos artificiales.

Muchas enfermedades están asociadas con la aparición de tejidos dañados irreparablemente. En estos casos, los órganos artificiales (por ejemplo, la diálisis) o el trasplante de órganos enteros (por ejemplo, corazón e hígado) son la terapia de elección. Sin embargo, ya que la regeneración es intrínseca a muchos órganos incluyendo el corazón, los riñones y el hígado, el desarrollo de otras modalidades de tratamiento que permiten la regeneración de los órganos representa un reto para la investigación médica en general y la medicina regenerativa en particular.

En este caso utilizaron las células autólogas (propias) de la piel y con el uso de un spray las “trasplantaron”  a la zona dañada por quemaduras. Para esto de la piel sana se separaron las capas de dermis y epidermis mediante digestión enzimática para el aislamiento de los queratinocitos basales. Luego de lavadas y centrifugadas las células se pusieron en una solución de Ringer lactato. El procedimiento se realizó in situ durante una sola sesión inmediatamente después de la biopsia. Las células fueron transplantadas inmediatamente con la pistola de celular para una distribución uniforme de la suspensión celular.

Esta nueva metodología no solo evita el cultivo de las células sino también reduce del tiempo de cierre de la herida. Esto  sugiere que el método puede potencialmente evitar complicaciones a largo plazo y ser una buena alternativa para el tratamiento de quemaduras y heridas no cicatrizantes.

Referencia

Gerlach JC, Johnen C, Ottoman C, Bräutigam K, Plettig J, Belfekroun C, Münch S, Hartmann B. Method for autologous single skin cell isolation for regenerative cell spray transplantation with non-cultured cells. Int J Artif Organs. 2011 Mar;34(3):271-9.

Estimado Profesor Mankiw:

“Hoy en día, estamos saliendo de su clase (Economía 10), con el fin de expresar nuestro descontento con el sesgo inherente a este curso introducción a la economía. Estamos profundamente preocupados por la forma en que esta tendencia afecta a los estudiantes, la Universidad, y nuestra sociedad en general”. Con esa misiva y la acción de retirarse de clases algunos estudiantes de la Facultad de Economía de Harvard protestaron por un nuevo orden mundial. Unos verdaderos ocupas en una de las más prestigiosas universidades del mundo.

Este hecho tiene una gran trascendencia en varios sentidos, las personas que pueden acceder a estudiar en Harvard, y particularmente en la Escuela de Negocios (Harvard Business School), son de las familias más ricas e influyentes de los EE.UU. Harvard es considerada por muchos rankings la mejor Universidad del Mundo y como la más antigua institución de enseñanza superior de los EE.UU tiene una enorme influencia en todo el mundo. Que estos estudiantes hayan tenido las agallas de desafiar a su profesor en Harvard y a la sociedad más conservadora estadounidense, no pasará inadvertido aunque lo quieran los medios masivos.

“Si falla la Universidad de Harvard para equipar a sus estudiantes de una comprensión amplia y crítica de la economía, sus acciones son susceptibles de perjudicar el sistema financiero mundial. Los últimos cinco años de crisis económica han sido prueba suficiente de ello”. Afirman en otro momento de la carta los estudiantes ocupas.

A mi juicio, lo más hermoso viene al final de la misiva donde clara y directamente adhieren a los movimientos sociales ocupas que están ocurriendo en muchas ciudades estadounidenses y particularmente al de Boston.

“Estamos saliendo hoy (de su clase) para unirnos a una marcha de protesta en todo Boston contra la mercantilización de la educación superior como parte del movimiento “Ocupa” a nivel mundial. Dado que la naturaleza sesgada de su curso, este contribuye y simboliza la creciente desigualdad económica en los Estados Unidos, estamos saliendo de su clase de hoy, tanto para protestar por la falta de discusión de la teoría económica básica como para prestar nuestro apoyo a un movimiento que está cambiando el discurso estadounidense sobre la injusticia económica”

¿Habrá influido de alguna manera el movimiento estudiantil chileno a sus similares de Harvard? Me vienen a la mente las imágenes de una protesta de estudiantes chilenos y estadounidenses de Harvard por la visita de Sebastian Piñera, ex estudiante de doctorado de la Escuela de Negocios. ¿Algunos de los estudiantes firmantes de la misiva habrá participado en la protesta contra el presidente que calificó de “una causa noble, grande, hermosa” al movimiento estudiantil chileno?

Referencia

Concerned students of Economics 10. An open letter to Greg Mankiw. Harvard Political Review.http://hpronline.org/harvard/an-open-letter-to-greg-mankiw/

Los invito a disfrutar la primera edición del boletín científico cultural bioBlogia. Un espacio donde se mezcla la ciencia, el arte y el diseño. Expándalo como un virus por sus amistades.

Referencia

Boletín bioBlogia #1: http://es.scribd.com/doc/68288969/Boletin-bioblogia-1

Einstein se remece en su tumba. Los científicos del experimento OPERA que investiga un haz de neutrinos que viaja desde el CERN hasta 730 kilometros de distancia en el Laboratorio Nacional Gran Sasso en Italia, han encontrado nuevos resultados sorprendentes. Los resultados parecen mostrar que los neutrinos viajan más rápido que la luz, algo que en principio contradice la teoría de Einstein de que nada puede viajar más rápido que la luz.

El resultado del proyecto OPERA está basado en la observación de más de 15.000 eventos de neutrinos medidos en el Gran Sasso, y parece indicar que el viaje de los neutrinos a una velocidad de 20 partes por millón por encima de la velocidad de la luz, la velocidad límite de lal naturaleza.

Dado lo extraordinario de las consecuencias del alcance de este resultado, son necesarios antes mediciones independientes para que el efecto pueda ser refutado o firmemente establecido. Esta es la razón por la que el proyecto de colaboración OPERA ha decidido abrir el resultado a un mayor escrutinio. El resultado de la colaboración está disponible en el servidor arXiv preprint (http://arxiv.org/list/hep-ex/new).

Este resultado se presenta como una completa sorpresa ya que después de muchos meses de estudios y controles cruzados no se ha encontrado ningún efecto instrumental que podría explicar el resultado de la medición. Mientras que los investigadores de OPERA continuarán sus estudios, se esta mirando mediciones independientes para evaluar plenamente la naturaleza de esta observación.

Cuando un experimento encuentra un resultado aparentemente increíble y no puede encontrar artefacto de la medición para dar cuenta de él, es el procedimiento normal el invitar a un mayor escrutinio, y esto es exactamente lo que la colaboración OPERA está haciendo lo que es una buena práctica científica.

Si esta medida se confirma, podría cambiar nuestro punto de vista de la física, pero tenemos que estar seguros de que no hay otra explicación más mundana. Y esto requiere mediciones independientes.

Para llevar a cabo este estudio, la colaboración OPERA ha unido a expertos en materia de metrología del CERN y de otras instituciones para llevar a cabo una serie de mediciones de alta precisión de la distancia del vuelo de los neutrinos entre la fuente y el detector. La distancia entre el origen del haz de neutrinos y la ópera fue medido con una incertidumbre de 20 cm sobre la ruta, 730 kilometros de viaje. El tiempo de vuelo de los neutrinos se determinó con una precisión de menos de 10 nanosegundos por el uso de instrumentos sofisticados como los sistemas avanzados de GPS y los relojes atómicos. El tiempo de respuesta de todos los elementos de la línea del haz CNGS y del detector de OPERA también se ha medido con gran precisión.

El impacto potencial en la ciencia y particularmente en la física es demasiado grande para sacar conclusiones o interpretaciones inmediatas.La primera reacción es que el neutrino nos sigue sorprendiendo con sus misterios. La intención es de invitar a un escrutinio de la comunidad de física de partículas más amplio.

El experimento de OPERA fue inaugurado en 2006, con el objetivo principal de estudiar las transformación raras u oscilaciones de los neutrinos muón en los neutrinos tau. Uno de estos eventos se observó por primera vez en el 2010, lo que demuestra la capacidad única de la experiencia en la detección de la señal difícil de los neutrinos tau.

Referencia

OPERA. Measurement of the neutrino velocity with the OPERA detector in the CNGS beam. arXiv.org, 2011; [link]

Siempre me ha llamado la atención que algunas personas sienten más cariño para con sus mascotas que para sus similares humanos. No importa cuál es nuestra respuesta a los animales, al parecer esta es debido a que tenemos una parte específica del cerebro que está cableada para detectar rápidamente las criaturas de la especies no humanas. De hecho, los investigadores del Instituto de Tecnología de California (Caltech) y UCLA informan que a lo largo de las neuronas de la amígdala, un centro en el cerebro conocido para el procesamiento de las reacciones emocionales, responden preferentemente a las imágenes de los animales.

El equipo de investigación publicó su hallazgo en la revista Nature Neuroscience luego de reclutar y analizar a 41 pacientes con epilepsia en el Ronald Reagan UCLA Medical Center. Estos pacientes ya estaban siendo monitoreados para la actividad cerebral relacionada con las convulsiones. Utilizando electrodos ya en marcha, el equipo registró las respuestas de una sola neurona de la amígdala en los participantes del estudio al observar las imágenes de personas, animales, lugares u objetos.

Las amígdalas son una estructura en forma de almendra con grupos de neuronas – células que son componentes fundamentales del sistema nervioso – situadas profundamente en el lóbulo temporal del cerebro.

El estudio muestra que las neuronas humanas en la amígdala responden preferentemente a las imágenes de los animales, lo que significa que observaron la mayor cantidad de actividad en las células neuronales cuando los pacientes mirar0n a los gatos o serpientes frente a los edificios o las personas. Esta preferencia se extiende a todos los animales, ya sean feos o peligrosos, es decir, parece ser independiente del contenido emocional de las imágenes. Sorprendentemente, nos encontramos que este comportamiento es único respuesta de la amígdala derecha y no de la izquierda.

Esta sorprendente asimetría hemisférica ayuda a fortalecer los resultados anteriores y apoyan la idea de que, al principio de evolución de los vertebrados, el hemisferio derecho se especializa en el tratamiento de los estímulos inesperados y biológicamente relevantes, o con los cambios en el medio ambiente.

En términos de la evolución del cerebro, la amígdala es una estructura muy antigua, ya lo largo de nuestra historia biológica, los animales, que podrían representar los depredadores o presas, eran una clase de gran relevancia para nuestros estímulos.

Nadie se hubiera imaginado que las células de la amígdala responde más a los animales que a los rostros humanos, y en particular, que responden a todo tipo de animales, no solo los peligrosos. Este estudio va a estimular más la investigación en este campo del comportamiento y tiene el potencial de ayudarnos a entender mejor las fobias a los animales.

Referencia

lorian Mormann, Julien Dubois, Simon Kornblith, Milica Milosavljevic, Moran Cerf, Matias Ison, Naotsugu Tsuchiya, Alexander Kraskov, Rodrigo Quian Quiroga, Ralph Adolphs, Itzhak Fried, Christof Koch. A category-specific response to animals in the right human amygdala. Nature Neuroscience, 2011; DOI: 10.1038/nn.2899

Las lagartijas verdes son criaturas ágiles y muy activas y al parecer lo son también algunos elementos de su genoma. Esta afirmación y otras muchas pistas han surgido a partir de la secuenciación completa del primer genoma de una lagartija. El conocimiento del genoma de este reptil ofrece una visión de cómo los genomas de los humanos, los mamíferos, y de los han evolucionado desde que los mamíferos y reptiles se separaron hace 320 millones de años. Imagino que el artículo publicado en la revista Nature pondrá muy contento a mi amigo y colega Alexander Vargas.

La lagartija verde (Anolis carolinensis), nativa del sureste de Estados Unidos, es la primera especie de reptil en tener su genoma secuenciado y ensamblado. Hasta ahora se han secuenciado y analizados más de 20 genomas de mamíferos, incluyendo los de algunos de nuestros parientes más cercanos, pero el paisaje genético de los reptiles se mantiene relativamente inexplorado.

Los lagartos están más estrechamente relacionados con las aves que a cualquiera de los otros organismos cuyos genomas han sido secuenciados en su totalidad. Al igual que los mamíferos, las aves y los lagartos son amniotas, lo que significa que no se limitan a poner los huevos en el agua. Los científicos han estado secuenciando los animales de diferentes partes del árbol de los vertebrados, pero los lagartos no habían sido incluidos en la muestras previas, una rama muy importante a tener en cuenta.

Las cuatrocientas especies de lagartijas que existen se desplegaron en las islas del Caribe, América del Norte, América Central y América del Sur, por lo que son un modelo interesante para estudiar la evolución. Aunque mucho se sabe sobre su biología y comportamiento, la información genómica puede ser una pieza clave que falta para la comprensión de cómo los lagartos se han diversificado tanto.

A pesar de que no han sido un organismo modelo para los estudios genéticos clásicos. El conocimiento de su genoma va a revolucionar nuestra capacidad de estudiar ese aspecto de su diversificación evolutiva.

Una de las tantas preguntas que este genoma secuenciado puede ayudar a resolver tiene que ver con el origen de la conservación de los elementos no codificante en el genoma humano. Estas regiones no contienen genes que codifican proteínas, pero se cree que tienen un papel fundamental, ya que se han mantenido sin cambios durante miles de años. Los científicos siempre se han  preguntado sobre los orígenes de estos elementos genéticos y  la hipótesis es que pueden ser reliquias de los transposones, fragmentos de ADN que “saltan” y que fueron a la vez capaz de copiar y pegarse a lo largo del genoma. En los seres humanos, muchos de estos llamados “genes saltarines” han perdido su capacidad de salto, pero en lagartijas, siguen intactos.

Las lagartijas tienen una biblioteca viviente de estos elementos de transposición. Los investigadores alinearon estos elementos móviles del genoma humano, y encontraron que cerca de 100 de los elementos no codificantes del genoma humano se derivan de estos genes “saltarine”s. En las lagartijas, estos transposones siguen saltando alrededor, pero la evolución los ha utilizado para sus propios fines, convirtiéndolos en algo funcional en los seres humanos.

Además de las ideas sobre el genoma humano y los mamíferos, el genoma de la lagartija también ofrece varias pistas sobre cómo evolucionaron las especies de lagarto para poblar las islas de las Antillas Mayores. Al igual que los pinzones de Darwin, los lagartijos se adaptaron para llenar todos los nichos ecológicos que las islas tienen que ofrecer.

Algunos lagartos tienen patas cortas y pueden caminar a lo largo de las ramas angostas, otros son de color verde con el dedo gordo del pie con almohadillas adaptadas para vivir en lo alto de los árboles, mientras que otros son de color amarillo y marrón y viven en la hierba. Pero a diferencia de los pinzones, las lagartijas en las diferentes islas han evolucionado de forma independiente. Numerosas especies de lagartos casi idénticas se han desarrollado de forma paralela en las islas de La Española, Puerto Rico, Cuba y Jamaica.

“Estos lagartos han sido comparados con los pinzones de Darwin y en muchos aspectos son similares”, dijeron los autores. “Ellos muestran el funcionamiento de la selección natural como especies adaptadas a los diferentes hábitats. Pero la diferencia en el caso de los lagartos, esta evolución ha sucedido cuatro veces, una en cada una de las diferentes islas.

Mediante el muestreo de los genomas de más de 90 especies, los investigadores fueron capaces de hacer un mapa preliminar de cómo estas especies evolucionaron para colonizar las islas.

Los investigadores también fueron capaces de crear una lista de partes de las proteínas que se encuentran en los huevos de las lagartijas verdes y las compararon con los encontrados en huevos de gallinas y encontraron que tanto los genes de las aves como los huevos del lagarto están evolucionando rápidamente. También encontraron varios genes en el genoma del anolis asociados con la visión del color para identificar a sus compañeros de selección por las papadas coloridas.

Las lagartijas tienen visión de colores muy buena, incluso algunas especies pueden ver en el rango ultravioleta. Otros estudios han demostrado que el anolis puede distinguir los colores y patrones similares. Es bastante claro que una de las funciones de la papada es distinguir unas especies de otras personas y que utilizan la papada para determinar si otra lagartija es de la misma especie o no.

Los investigadores realizaron el primer análisis de otras características inusuales en el genoma del lagartijo, incluyendo los microcromosomas o cromosomas pequeños que a veces se encuentra en los reptiles, anfibios y peces, pero nunca en los mamíferos. También encontraron una falta total de Isocoras, las regiones del genoma con una concentración alta o baja de los nucleótidos “G” (guanina) y “C” (citosina) que están presentes en los cromosomas humanos con diferentes patrones de bandas.

Además, el equipo encontró los cromosomas sexuales del lagarto, algo que los investigadores sólo habían sido capaces solo de hipotetizar antes. Al igual que los mamíferos, las lagartijas verdes parecen tener los cromosomas XX y XY (a diferencia de las aves, en la que los machos tienen dos cromosomas sexuales idénticos llamado ZZ y las hembras tienen dos diferentes conocidas como ZW).El cromosoma X de la lagartija resultó ser uno de sus muchos microcromosomas.

Cada una de estas ideas es el fruto de la colaboración entre los científicos especializados en el estudio de las proteínas, la evolución de la familia de los genes, la conducta de la lagartija verde, el análisis computacional, y mucho más. Este trabajo representa una asociación entre los biólogos y los biólogos computacionales y han sido capaces de aprovechar todos estos puntos de vista para comprender mejor la evolución del genoma en general.

Referencia

Jessica Alföldi, Federica Di Palma, Manfred Grabherr, Christina Williams, Lesheng Kong, Evan Mauceli, Pamela Russell, Craig B. Lowe, Richard E. Glor, Jacob D. Jaffe, David A. Ray, Stephane Boissinot, Andrew M. Shedlock, Christopher Botka, Todd A. Castoe, John K. Colbourne, Matthew K. Fujita, Ricardo Godinez Moreno, Boudewijn F. ten Hallers, David Haussler, Andreas Heger, David Heiman, Daniel E. Janes, Jeremy Johnson, Pieter J. de Jong, Maxim Y. Koriabine, Marcia Lara, Peter A. Novick, Chris L. Organ, Sally E. Peach, Steven Poe, David D. Pollock, Kevin de Queiroz, Thomas Sanger, Steve Searle, Jeremy D. Smith, Zachary Smith, Ross Swofford, Jason Turner-Maier, Juli Wade, Sarah Young, Amonida Zadissa, Scott V. Edwards, Travis C. Glenn, Christopher J. Schneider, Jonathan B. Losos, Eric S. Lander, Matthew Breen, Chris P. Ponting, Kerstin Lindblad-Toh. The genome of the green anole lizard and a comparative analysis with birds and mammals. Nature, 2011; DOI:10.1038/nature10390

Medicinal Genomics, una compañía holandesa pionera en la genómica de las plantas medicinales, ha anunciado hoy que ha secuenciado el genoma completo de dos variedades de marihuana: Cannabis sativa y Cannabis indica, en lo que constituye hasta hoy el montaje de la colección más grande de genes conocidos de esta controvertida planta terapéutica. La purificación del ADN se realizó en las instalaciones de investigación de la compañía en Ámsterdam, y la secuencia se llevó a cabo por varios proveedores de servicios, incluyendo la última tecnología 454 de secuenciación masiva de Roche.

Según los autores, a pesar de la evidencia convincente de los beneficios terapéuticos del cannabis, la investigación genómica sobre esta planta era muy pobre hasta el dia de hoy. Anteriormente, sólo dos millones de bases de secuencia de Cannabis habían sido depositados en el GenBank, una base de datos de secuencia proporcionada por el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI).

Hasta la fecha, Medicinal Genomics ha secuenciado más de 131 mil millones de bases de la secuencia, lo que representa un aumento de 65.000 veces en lo que se ha compartido públicamente sobre el genoma de Cannabis. Al mismo tiempo, la compañía ha publicado las secuencias obtenidas de Cannabis sativa en el servicio en EC2 de Amazon, un servicio de almacenamiento público que permitirá el acceso de la comunidad científica para llevar a cabo nuevas investigaciones. La secuencia del genoma de Cannabis indica se pondrá a disposición en el servidor EC2 de Amazon en un par de semanas también. Las anotaciones del genoma serán accesible a través de una aplicación iPad que la compañía espera lanzar en el otoño.

Para la compañía es muy importante proporcionar a la comunidad científica los datos sin procesar de la secuencia lo más rápido posible. La investigación científica actual sugiere que algunos de los compuestos no tóxicos de esta planta en última instancia, pueden llegar a ser importantes en la terapia de algunas enfermedades muy importantes, incluyendo el cáncer y las enfermedades inflamatorias.

Más del 40 de las solicitudes hechas en EE.UU. por la Food and Drug Administration (FDA) aprobaron la evaluación de ensayos clínicos del cannabis como terapia se ya se han completado o están en curso, de acuerdo con la información obtenida de www.clinicaltrials.gov .

Es excelente para ver las políticas de liberación rápida de los datos de la secuencia, algo que si bien es común en las organizaciones públicas no lo es tanto en las Compañías privadas, sobre todo cuando se trata de estos genomas desafiantes.

Con el genoma completo en la mano, los investigadores podrán comenzar a identificar los compuestos no psicoactivos o vías enzimáticas para aclarar mejor los beneficios terapéuticos del cannabis, incluyendo las propiedades anti-cancerígenas de la planta. Estas vías pueden ser optimizados en la planta o clonados en otras plantas u organismos para una producción más eficiente. Además, puede ser posible a través de la secuencia del genoma obtener variedades atenuadas de los efectos psicoactivos del cannabis, al tiempo que se mejoran los aspectos medicinales.

Referencia

Secuencia del genoma: http://csativa.elasticbeanstalk.com/

Sitio web de la Compañia Medicinal Genomics: http://www.medicinalgenomics.com/