Secuencian completamente el genoma del durazno

 

El rápido crecimiento de árboles como los álamos y los sauces los convierten en candidatos ideales para los cultivos que se utilizan como biocombustibles. La domesticación de estos cultivos requiere un profundo conocimiento de la fisiología y la genética de los árboles, y para esto los científicos están recurriendo a los árboles frutales de larga domesticación en busca de pistas. La relación entre un durazno y un álamo puede no ser obvia a primera vista, sin embargo para los botánicos ambos árboles son parte de la superfamilia rosid, que incluye no sólo los cultivos de frutas como manzanas, fresas, cerezas y almendras, sino también muchas otras plantas, como las rosas que le dan el nombre a la superfamilia.

duraznos

 

Un consorcio internacional de varios laboratorios, incluyendo laboratorios chilenos, se unieron en el Consorcio Internacional del Genoma del Durazno (International Peach Genome Initiative) y publicaron la secuencia de los 265 millones de bases del genoma de la variedad de Lovell de Prunus persica. Los resultados fueron publicados en la revista Nature Genetics.

La utilización de los enfoques de genómica comparada permiten no solo la caracterización de la secuencia del genoma del durazno para la mejora y sostenibilidad de este fruto y otras especies arbóreas importantes, sino también para mejorar nuestra comprensión de la biología básica de los árboles. Para esto compararon a 141 familias de genes del durazno con las de otros seis genomas de plantas totalmente secuenciadas para desentrañar las vías metabólicas, por ejemplo, los que conducen a la biosíntesis de lignina, la molecula “pegamento” que mantiene las células vegetales juntas y constituye una barrera clave para la deconstrucción de la biomasa en los combustibles.

Para los investigadores en bioenergía, el tamaño del genoma del durazno hace ideal para servir como un modelo de planta para el estudio de genes que se encuentran en los genomas relacionados, tales como el álamo y desarrollar métodos para mejorar el rendimiento de las plantas que se utilizan como biomasa para biocombustibles.

Por ejemplo el locus llamado “hoja perenne” de los melocotones, que se conoce extiende la temporada de crecimiento podría ser manipulado en el álamo para incrementar la acumulación de biomasa.

La publicación se produce tres años después de que el Consorcio Internacional del Genoma del Durazno hizo público el proyecto de montaje del genoma del durazno y que fue anotado en el portal de genomas Phytozome.net y en otros sitios web.

Entre los investigadores chilenos que formaron parte de esta iniciativa se encuentran Ariel Orellana, Lee A. Meisel, Herman Silva y Susana González.

Referencia

Ignazio Verde, Albert G Abbott, Simone Scalabrin, Sook Jung, Shengqiang Shu, Fabio Marroni, Tatyana Zhebentyayeva, Maria Teresa Dettori, Jane Grimwood, Federica Cattonaro, Andrea Zuccolo, Laura Rossini, Jerry Jenkins, Elisa Vendramin, Lee A Meisel, Veronique Decroocq, Bryon Sosinski, Simon Prochnik, Therese Mitros, Alberto Policriti, Guido Cipriani, Luca Dondini, Stephen Ficklin, David M Goodstein, Pengfei Xuan, Cristian Del Fabbro, Valeria Aramini, Dario Copetti, Susana Gonzalez, David S Horner, Rachele Falchi, Susan Lucas, Erica Mica, Jonathan Maldonado, Barbara Lazzari, Douglas Bielenberg, Raul Pirona, Mara Miculan, Abdelali Barakat, Raffaele Testolin, Alessandra Stella, Stefano Tartarini, Pietro Tonutti, Pere Arús, Ariel Orellana, Christina Wells, Dorrie Main, Giannina Vizzotto, Herman Silva, Francesco Salamini, Jeremy Schmutz, Michele Morgante, Daniel S Rokhsar. The high-quality draft genome of peach (Prunus persica) identifies unique patterns of genetic diversity, domestication and genome evolutionNature Genetics, 2013; DOI: 10.1038/ng.2586

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Francisco P. Chávez Profesor Asistente, Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Departamento de Biología Facultad de Ciencias Universidad de Chile

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Francisco P. Chávez Ph.D
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